Introducción histórica. Delimitación, volumen y configuración de las aguas epicontinentales. El agua y las sustancias que lleva en solución. Energía radiante y mecánica del agua. Ocupación de las aguas continentales y proyección geográfica y ecológica de la evolución. Organización, teoría y modelado de los ecosistemas. Productores primarios del plancton. Zooplancton. Algas del bentos y macrófitos. Invertebrados bentónicos. Peces y demás vertebrados. Bacterias, hongos y otros organismos que utilizan materia orgánica disuelta. Integración y regulación del ecosistema. Lagos. Ríos. Embalses. Ecosistemas forzados. Comunidades acuáticas en condiciones extremadas. Sedimento, bentos profundo y paleolimnología.